Справляння портових зборів (корабельного, канального, маякового, причального, якірного, адміністративного, санітарного) в українських морських портах здійснюється відповідно до Кодексу торговельного мореплавства України та Положення № 1544, п. 11 якого встановлено, що ПДВ при справлянні портових зборів у валюті України сплачується відповідно до законодавства. При цьому, якщо в порту надаються послуги суднам каботажного плавання, сума зборів, визначена відповідно до цього Положення, збільшується на суму ПДВ, а в інших випадках сума ПДВ, що підлягає сплаті до бюджету, обчислюється із суми зборів, нарахованих і сплачених порту без такого збільшення.
Тобто зазначеним Положенням розміри ставок портових зборів для суден каботажного плавання затверджено без урахування ПДВ, а тому при справлянні зазначених зборів згідно з нормами п. 4.1 ст. 4 та пп. 6.1.1 п. 6.1 ст. 6 Закону № 168/97-ВР ПДВ має додаватися до суми такого збору. Для інших суден розміри ставок портових зборів затверджено з урахуванням ПДВ. Тому сплата їх здійснюється без такого збільшення.